La moule perlière d’eau douce Margaritifera margaritifera, vit dans les rivières d’excellente qualité des massifs anciens. Considérée comme une espèce « parapluie », elle est au bord de l’extinction dans le Massif Armoricain. Le but du programme européen LIFE, coordonné par Bretagne Vivante, est de contribuer à la conservation des 6 principales populations de moules perlières restantes en Bretagne et Basse-Normandie.

Le phragmite aquatique Acrocephalus paludicola est une fauvette aquatique d'une dizaine de grammes. Le phragmite aquatique est le passereau le plus menacé d'extinction en Europe continentale.
Il ne subsiste plus que 11 400 à 13 500 mâles chanteurs (soit 30 000 individus au total), confinés à une cinquantaine de sites de reproduction en Europe de l'Est.

Le phragmite aquatique migre en nombre par la Bretagne en août et en septembre, au cours de son voyage vers l'Afrique où il passera l'hiver.

La sterne de Dougall Sterna dougallii est l'une des espèces d'oiseaux de mer les plus menacées en Europe. L'effectif français représente à peine 5 % de la population européenne (îles Britanniques et archipel des Açores).

En France, elle se reproduit exclusivement en Bretagne sur des îlots marins rocheux au sein de colonies de sternes caugek et pierregarin.

Les sternes de Dougall qui se reproduisent en Europe migrent à partir du mois d'août vers les rives d'Afrique de l'ouest.